从公司法第33条第3款规定：“公司应当将股东的姓名或者名称及其出资额向公司登记机关登记；登记事项发生变更的，应当办理变更登记。未经登记或者变更登记的，不得对抗第三人。”由此可判断，办理工商变更登记是为了使股权转让协议产生对抗第三人的效力。又根据新公司法第74条规定“依照本法第七十二条、第七十三条转让股权后，公司应当注销原股东的出资证明书，向新股东签发出资证明书，并相应修改公司章程和股东名册中有关股东及其出资额的记载。对公司章程的该项修改不需再由股东会表决。”此规定明确股权转让后须变更股东名册。

虽然公司工商变更登记不影响股权转让协议的效力，但由于变更登记会产生对抗第三人的法律效果，而且就现今由于股权转让未办理工商变更登记的争议也非常多，故建议在股权转让后应依据公司法及相关规定的要求尽快办理相应的变更登记，只有办理完所有的变更要求后，一个股权转让行为才算完全、彻底。（此处由于没有合适的案例，就不在列举）